فقد اشاد ممثل المرجعية الدينية المتولي الشرعي للعتبة الحسينية المقدسة سماحة الشيخ عبد المهدي الكربلائي بعمل الهيئة قائلاً "بأن الهيئة القرآنية العليا في العتبات والمزارات قدمت عملا كبيرا
تمثل بمشروعها القرآني "المحطات القرآنية في الزيارة الأربعينية" الذي يعد الغذاء الروحي ومن اهم الامور التي تقدم الى الزائرين خلال اربعينية الامام الحسين (عليه السلام) ، كما اثنى على الجهود التي تقدمها العتبات والمزارات الى الزائرين الذين وفدوا الى قبلة الاحرار ورمز الثوار الامام الحسين (عليه السلام) في جميع الجوانب الخدمية والدينية ، مؤكداً على اهمية " توحيد الصفوف والعمل القرآني المشترك "
من الجدير ذكره ان الامناء العامين للعتبات المقدسة والمزارات الشريفة في العراق باركوا تأسيس الهيئة القرآنية العليا في العتبات والمزارات وتقديم كل الدعم ماديا ومعنويا لانجاح مشاريعها القرانية .